De los ADN hallados en el Portalón no ha trascendido el ATP03. Fue datado por radiocarbono en el periodo Calcolítico de Iberia (Edad del Cobre), con una antigüedad aproximada de entre 5.466 y 5.312 años antes del presente. Su linaje materno (ADN mitocondrial) pertenece al haplogrupo K1a2b, y su linaje paterno (Cromosoma Y) se le asignó el haplogrupo R1b-P297, una rama antigua de R1b (Reich 2022).

En el estudio original publicado por Günther et al. (2015) la muestra de ATP03 ofreció una cobertura genética baja. En aquel año, ATP03 parece que dio positivo SNP: R:F370/PF6047/M708/Y479,R1:M748/YSC0000207; y negativo en SNP: R1b1b-PF6330(C->T),R1b1b-FGC21020(C->A). Siendo considerado entonces como YTree R1(xV88). R-V88 (YSC0000207) es el que protagonizó una retro-migración hacia África, siendo hoy un testimonio genético de que las migraciones humanas nunca fueron en una sola dirección.

Y debido a que ATP03 era un agricultor calcolítico de Atapuerca SIN ASCENDENCIA ESTEPARIA, muchos aficionados y genetistas asumieron inicialmente de forma extraoficial que debía tratarse de V88, dado que este era el único linaje R1b conocido en la Iberia de esa época (como en Els Trocs o Cerdanyola). Sin embargo, los datos crudos no respaldaban la mutación V88.

Años más tarde, en julio de 2022, laboratorios de paleogenética de referencia mundial (como es el Reich Lab de la Universidad de Harvard) limpiaron y re-analizaron los datos de ATP03 con herramientas moleculares actualizadas. El reprocesamiento de alta resolución de los datos ATP03 de El Portalón está disponible a través del Allen Ancient DNA Resource (AADR. https://www.nature.com/articles/s41597-024-03031-7 ), una base de datos pública e integral mantenida por el Laboratorio Reich de la Universidad de Harvard.

Los análisis detallados, incluida la reclasificación de la muestra ATP03 al linaje R1b1a1 (R-P297), se pueden encontrar tambien en los datos complementarios del estudio de Olalde 2019 publicado en Science, y mediante análisis bioinformáticos especializados en el blog de Eurogenes. Se analizó la muestra leyéndola gen a gen de forma aislada (llamado read scouting) y aparecen mutaciones coincidentes con P297. La secuenciación definitiva determinó que ATP03 pertenece a la rama R1b1a1-P297. (https://dataverse.harvard.edu/dataverse/reich_lab )

R-P297 es la rama "hermana" de V88, y de enorme relevancia histórica porque de este mismo tronco (P297) nace la mutación M269, el linaje masivo que explotaría en la Edad del Bronce y que hoy domina Europa Occidental.

Por lo tanto, ATP03 es un hallazgo extraordinario ya que representa a una de las escasísimas líneas basales europeas de R-P297 que ya se encontraban en el suroeste de Europa de manera local ANTES de las invasiones masivas de las estepas.

Al reconstruir su código genético, los investigadores pudieron predecir sus características físicas principales basándose en los genes responsables de la pigmentación y la anatomía:

  1. A diferencia de los cazadores-recolectores europeos anteriores (como el famoso hombre de La Braña en León, que tenía ojos azules pero piel oscura), ATP03 tenía los ojos marrones. Este rasgo era el predominante en las poblaciones de primeros agricultores de El Portalón (como ATP04 o ATP05), reflejando su herencia mayoritaria procedente de las migraciones de Anatolia.
  2. ATP03 y su grupo ya portaban las variantes genéticas definitivas asociadas a una pigmentación clara de la piel (mutaciones en genes clave como SLC24A5 y SLC45A2). Esta adaptación fue crucial para los agricultores del Neolítico y Calcolítico en Europa: al cambiar su dieta de cazadores (rica en vitamina D por el consumo de carne y pescado) a una dieta basada en cereales, necesitaban una piel más clara para absorber de forma eficiente los rayos ultravioletas del sol y sintetizar la vitamina D.
  3. El genoma de ATP03 indica una probabilidad muy alta de tener el cabello oscuro y liso.
  4. No podía beber leche cruda: A pesar de ser un ganadero que vivía rodeado de ovejas, cabras y vacas en la Sierra de Atapuerca, el análisis genético demostró que ATP03 era intolerante a la lactosa en la edad adulta. Consumían los lácteos únicamente de forma procesada (como queso o yogur), donde los niveles de lactosa se reducen drásticamente.

La mutación que permite a los adultos europeos beber leche de forma natural (gen LCT) SI existía en la península en esa época y NO fue introducida de forma masiva miles de años después por las poblaciones esteparias donde no está presente en esa época. En resumen, si pudiéramos ver a ATP03 de hace 5.000 años, veríamos a un hombre de piel clara, cabello oscuro y ojos marrones, con un aspecto físico directo y muy similar al de muchos habitantes actuales de la cuenca mediterránea.

SORPRESA

Antes de ATP3, la teoría dominante dictaba que el linaje R-M269 (y sus descendientes L51 y P310) no existía en Europa Occidental antes del año 2500 a.C. Se asumía que este linaje había llegado exclusivamente desde las estepas euroasiáticas (cultura Yamnaya) durante la Edad del Bronce.

Encontrar a un individuo en Atapuerca con mutaciones basales de P297 hacia el 3400 a.C. nos dice que:

  • Surgió en una fecha anterior a las migraciones masivas de las estepas hacia la península ibérica.
  • El individuo tenía un perfil autosómico puramente de agricultor neolítico europeo, SIN RASTRO de herencia genética de las estepas (Steppe ancestry)

Aceptar en Reich-2022, de forma categórica que ATP03 era un R-P297 "puro" antes de las invasiones de las estepas derribara parte del modelo migratorio europeo que el propio David Reich demostró en sus estudios de 2018 y 2019. Su modelo anterior sostiene que el R1b actual entró a la península ibérica de forma masiva sustituyendo casi al 100% de las líneas paternas locales solo a partir del 2500 a.C. 

Mattias Jakobsson y Torsten Günther (Universidad de Uppsala, Suecia, 2015) publicaron un estudio clave en la revista PNAS ("Ancient genomes link early Balkan farmers to Stalsögra and Demonstrate Basque isolation"). Secuenciaron esqueletos neolíticos y calcolíticos de la cueva de El Portalón (Atapuerca, Burgos) y los compararon con poblaciones modernas. El ADN autosómico determino que los vascos modernos muestran la mayor proximidad autosómica con los primeros agricultores neolíticos (EEF) de la península, confirmando que su herencia mayoritaria (más del 50%) procede de los primeros labriegos de la Edad de Piedra y mezclados con cazadores locales y casi total ausencia de aporte estepario.

Imagen Mattias Jakobsson y Torsten Günther (Universidad de Uppsala, Suecia, 2015)

Los demás varones neolíticos y calcolíticos de la cueva del Portalón mostraron los linajes paternos típicos y dominantes de la Europa pre-indoeuropea. 

Olalde usó a ATP03 (calcolítico de Atapuerca-Burgos) en 2019 precisamente para demostrar la desconexión entre un marcador patrilineal y la sangre global. El algoritmo de 2019 lo agrupó de forma invariable junto a la población NATIVA del Calcolítico de la península ibérica. El cálculo arrojó un 0% de componente estepario, y las evidencias definitivas de que existían pequeños linajes R1b en el norte de España plenamente integrados en las comunidades nativas europeas de agricultores, siglos antes de que ocurriera el drástico reemplazo demográfico y genético de la Edad del Bronce.

Resumen del grupo de El Portalón (ATP) en Olalde 2019

Código de Muestra Periodo Arqueológico Cromosoma Y ¿Tiene ADN Estepario?
ATP01 Calcolítico No disponible (Mujer) 0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP02 Calcolítico / Edad del Cobre G2a2 0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP03 Calcolítico / Neolítico Final R1b-P297 (basal) 0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP05 Neolítico Antiguo / Medio G2a2 0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP06 Neolítico Líneas maternas (H) 0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP07 Calcolítico Líneas maternas (J)
0% (100% Neolítico/Cazador local)
ATP09 Edad del Bronce1600 a.C. No disponible (Mujer) SÍ (~25-30%) (Muestra el fin del aislamiento)

La serie ATP de El Portalón fue vital para Olalde (2019) porque demostró la transición biológica en un mismo lugar: los ATP del 1 al 7 certifican una población estable, puramente neolítica y libre de trazas de los kurganes rusos, mientras que la llegada de ATP09 confirma que gentes del Vaso Campaniforme terminaron volviendo, como un bumerang, al corazón de la Sierra de Atapuerca, cambiando para siempre el mapa genético de la región y probablemente debido al Evento Climático 3.2k (1.300 a.C. al 1.200 a.C.), uno de los cambios climáticos más drásticos y que se caracterizó por una mega sequía severa y un enfriamiento repentino en todo el hemisferio norte.

El caso aún no se ha cerrado… ¿tendrán los rusos algo que decir?